Autores: Luis Tataje Lavanda1,2,
David Requena1,3, Angela Montalván1,4, Manolo Fernández1.
1 FARVET S.A.C.
2. Laboratorio de Biotecnología Molecular y Genómica
3. Unidad de Bioinformática
4. Laboratorio de Microbiología y Serología
2. Laboratorio de Biotecnología Molecular y Genómica
3. Unidad de Bioinformática
4. Laboratorio de Microbiología y Serología
Resumen:
En el presente informe se comunica por primera vez en
Perú la presencia de variantes del virus de la Bronquitis Infecciosa dentro de los genotipos
Sur Americano I (SAI) y Sur
Americano II (A/SAII), ambos serotipos difieren claramente de
las cepa vacunal Massachusetts (Marandino et al; 2015). Reportamos variantes de
la cepa CHINA (CK/CH/LDL/971) A/SAII,
denominándole a nuestro aislados VFAR-47
(2014), VFAR-75 (2015), VFAR-78 (2015), VFAR-79 (2015).
Asimismo reportamos el aislamiento del genotipo SAI: VFAR-77 (2015) el que también ha sido encontrado en
otros países como Argentina, Brasil y Uruguay y se calcula que ha emergido
aproximadamente en 1964 y existen reportes que se encuentra circulando junto a
la cepa Massachusetts (Marandino, et al; 2015).
Introducción:
El virus de la bronquitis aviar (IBV, del inglés
Infectious Bronchitis Virus) es un patógeno altamente contagioso que causa
serios problemas económicos a la industria avícola mundial, afectando tanto a
gallinas ponederas como a pollos broilers (Mondal & Chang; 2013). Las
frecuentes mutaciones y recombinaciones genéticas son las principales causas
del surgimiento de nuevos serotipos de IBV, y estos confieren poca o nula
protección cruzada, lo cual genera un mayor desafío en cuanto a la prevención y
control de IBV (Mo, et al; 2013). Recientemente diversas variantes de IBV han
emergido en Latinoamérica causando problemas respiratorios, nefropatogénicos y
reproductivos los cuales requieren cambios dramáticos en los programas de
programación, por ello la continua determinación de la epidemiología de los
serotipos y producción de nuevas vacunas son cruciales para el control de IBV
en cada región geográfica del país (Feng, et al; 2012).
El IBV es miembro del género Gammacoronavirus, subfamilia
Coronavirinae, familia Coronaviridae y orden Nidovirales (ICTV, 2015). Su
genoma de aproximadamente 27.6 kilobases (kb) está compuesto por ARN de sentido
positivo de cadena simple (ssRNA+). Dos tercios del genoma del virus codifican
a dos poliproteinas (1a y 1b) y el tercio restante codifica proteínas y
accesorias. Dentro de estas proteínas estructurales tenemos: La Glicoproteína
Spike (S), la Envoltura (E), la Glicoproteína de Membrana (M) y Nucleocapside
(N) (Mo, et al; 2013).
La glicoproteína Ses post-transcripcionalmente clivada en
dos subunidades (S1 y S2). Presenta una amplia variedad de epitopes antigénicos
asociados con tres regiones hipervariables (HVR 1, 2 y 3) que pueden inducir la
producción de anticuerpos nuetralizantes específicos y también activar la
inmunidad celular (Bourogâa, et al; 2012; Kammon, et al; 2013). La porción S1
es altamente variable pudiendo diferir de 20 a 50% en su composición de
aminoácidos entre serotipos esta propiedad convierte a S1 en un gen ideal
paratipificación molecular de IBV por RT-PCR y secuenciación (Ababneh, et al;
2012). La secuenciación de nucleótidos y el análisis genético brindan un rápido
y preciso método para clasificar y predecir serotipos, y son un poderoso
instrumento para monitorear la evolución filogenética y epidemiológica de los
subtipos de IBV (Han, et al; 2011).
FARVET realiza monitoreos continuos a lo largo del país,
como parte de su programa de vigilancia continua en busca de nuevas amenazas
virales y bacterianas que afecten a la industria avícola. En el año 2014 y
2015, al norte y sur del país se encontraron casos de IBV atípicos, la mayoría
de ellos presentando cuadros respiratorios suaves y no mortales.
Metodología
Se recolectaron animales con sintomatología atípica de
Bronquitis, y las muestras que dieron positivo al análisis de PCR en tiempo
real, se procedieron a aislar en huevos SPF para así incrementar el título
viral. Los genes S1 y N fueron amplificados y secuenciados en todas las
muestras. Se ensamblaron las secuencias con herramientas bioinformáticas y por
análisis filogenéticos se clasificaron a las cepas halladas.
Resultados y discusión
El análisis del gen S1, el aislado VFAR-77 se ubicó en el
grupo Sur Americano I (SAI) y los aislados VFAR-47, VFAR-75, VFAR-78, VFAR-79
se ubicaron en el grupo Sur Americano II (A/SAII).
El genotipo SAI ha sido encontrado en otros países como
Argentina, Brasil y Uruguay y se calcula que ha emergido aproximadamente en
1964 y existen reportes que se encuentra circulando junto a la cepa
Massachusetts (Marandino, et al; 2015).
El genotipo A/SAII ha sido reportado en Argentina,
Uruguay, China y Taiwan. Estas variantes pertenecen al grupo CK/CH/LDL/971
reportados en China desde 1996 (Han, et al, 2011). Se les asocia con
proventriculitis y nefritis (Liu, et al; 2009; Yu, et al; 2001). A pesar de la
distancia intercontinental se podría pensar en varias posibilidades de cómo
llegó esta cepa a nuestro país: Comercio internacional, aves migratorias y
revisión de vacunas atenuadas.
La habilidad del IBV de mutar continuamente ofrece una
oportunidad única a la comunidad científica para detallar estudios en la
dinámica de subpoblaciones virales que es requerida para una mejor comprensión
de la evolución de IBV y su epidemiología (Li, et al; 2013).
